菌種鑒定是什么
發(fā)布時(shí)間:2021-03-18
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一、菌種鑒定目的
通過形態(tài)特征、理化特性、遺傳進(jìn)化角度等闡明微生物種群之間的分類學(xué)關(guān)系,確認(rèn)菌種的身份。
二、菌種鑒定方法
菌種鑒定一般就只要提取基因組DNA,然后PCR擴(kuò)增16s rDNA片段,上機(jī)測(cè)序之后,上GeneBank或者Eztaxon對(duì)比即可。一般序列相似度在99%以上就可以認(rèn)為是同一個(gè)種細(xì)菌。
三、DNA測(cè)序流程
(1)基因組DNA提取和檢測(cè)
(2)16SrDNA/18SrDNA擴(kuò)增
(3)產(chǎn)物純化,上機(jī)測(cè)序,序列比對(duì)分析
四、菌種鑒定報(bào)告(樣本)
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